Középkori magyarországi, osztrák és német gyűjtemény
Tematikus válogatások
Szentévek emlékezete pápai érmeken (kiállítás 2024-2025); falikárpitok, Antoni Waterloo grafikái, Pituk József: Isteni színjáték, Fischer Ernő művei, Nádas László grafikái, Szántó Piroska bibliai képei, Bazsonyi Arany grafikái
Itáliai reneszánsz és barokk festészet
Az európai művészet emlékei között nemzetközi szinten is kimagaslik a Keresztény Múzeum itáliai festészeti gyűjteménye.Az állandó kiállításon látható több mint száz mű Itália festészetének a 13. század végétől a 18. századig ívelő korszakáról nyújt áttekintést.
Németalföldi és holland festészet
A Keresztény Múzeum németalföldi festményeinek a gyűjteménye nem ad ugyan olyan szinte hiánytalan összképet a fejlődésről, mint az itáliai gyűjtemény anyaga, de igen jelentős műveket mondhat magáénak.
Grafikai gyűjtemény
A több mint 5000 darabot számláló grafikai gyűjtemény öt évszázad nyomatait, vízfestményeit és rajzait őrzi. A lapok nagyobbrészt a múzeumalapító Simor János érsek gyűjtéséből származnak.
19. századi festészet és szobrászat
A múzeumalapító Simor János szándéka az volt, hogy a mindenkori kortárs művészet megértését elősegítendő gyűjtse a régi korok emlékeit. Az általa elfogadott egykorú művészektől ugyancsak rendszeresen vásárolt és megrendelt műveket.
20-21. századi festészet és szobrászat
Kortárs műveket megszerzésére az elmúlt ötven évben nagyobb hangsúly helyeződik a múzeumban. Figyelemreméltó darabok egészítik a régi gyűjteményt.
Ikongyűjtemény és ortodox fémművesség
A legrégebbi, 16-17. századi krétai és egyéb görög ikonok Ipolyi Arnold gyűjteményéből kerültek Esztergomba. A klasszikus orosz ikonok mellett a Magyarországon élő ortodox vallású népek, szerbek, románok festészetét is képviseli néhány újabb, 19-20. századi darab.
